Теплоходы-буксиры, плавучие краны, специальные мусорозагребающие катера регулярно очищают водную гладь от мусора и загрязнений, а также убирают иловые отложения в районах выхода воды из дренажной системы. Как отмечают эксперты «Мосводостока», вся водная территория Москвы — включая реки и судоходную часть Яузы — находится под постоянным контролем.